پس از آنکه عملیات خرابکاری گسترده به تاسیسات اتمی رژیم، زیان سنگینی وارد ساخت و همگان از آنچه که حفره های اطلاعاتی نامیدند زبان به شکایت گشودند، حکومت اکنون تصمیم دارد کار حفاظت از این تاسیسات به دست سپاه پاسداران بسپارد و به این ترتیب سپاه بر نقش دیگری از مدیریت های حفاظتی و امنیتی رژیم ایران مستقر می شود .
برخی از رسانه‌ها ی ایران هم در روزهای اخیر ، گزارش‌هایی درباره واگذاری سیستم حفاظت از سایت‌های هسته‌ای این کشور به سپاه پاسداران منتشر کرده و نوشته اند که با نظر ستاد کل نیروهای مسلح حکومت “از این پس سپاه پاسداران درباره اقدامات حفاظتی سایت‌های هسته‌ای تصمیم گیری می‌کند، این در حالی که پیش از این حفاظت سایت‌ها بر عهده سپاه بوده است.”
روابط عمومی شورای عالی امنیت ملی حکومت هم در این باره به باشگاه خبرنگاران جوان وابسته به سپاه گفته است : “شورای عالی امنیت ملی اگر لازم باشد تصمیمات اتخاذ شده خود را اطلاع رسانی کند، از طریق سخنگو و منابع رسمی این شوراها اقدام خواهد کرد”.
پیشتر اسحاق جهانگیری، معاون اول روحانی در ارتباط با خرابکاری اخیر نطنز، خواستار مواخذه سپاه در این باره شده بود.مسئولیت حفاظت از امنیت تاسیسات هسته‌ای ایران بر عهده سپاه پاسداران است.
اسحاق جهانگیری، گفته بود که باید نهادی که مسئول تامین امنیت تاسیسات هسته‌ای و جلوگیری از خرابکاری بزرگترین دشمن جمهوری اسلامی است درباره خرابکاری روز گذشته پاسخگو باشد.
کل برنامه اتمی حکومت ایران از روز نخست توسط سپاه پاسداران مدیریت و برنامه ریزی شده و طبعا حفاظت از تاسیسات آن نیز به دست همین نهاد بوده است .
از دو دهه پیش مسئولیت حفاظت از تاسیسات هسته‌ای، دانشمندان هسته‌ای ایران و شناسایی تهدیدات در این حوزه را برعهده داشته است.
پیشتر در اثر قطع برق در مجتمع غنی‌سازی نطنز تعدادی از سانتریفیوژهای فعال در این مرکز دچار سانحه شدند. جمهوری اسلامی این رویداد را نتیجه خرابکاری و ظریف آن را تروریسم هسته‌ای خواند. هنوز برآورد دقیقی از میزان خسارت به برنامه هسته‌ای ایران به صورت رسمی منتشر نشده است ولی مجموعه صحبت‌های مقام‌های جمهوری اسلامی نشان میدهد تعداد قابل توجهی از سانتریفیوژهای فعال در نطنز از مدار خارج شده و خسارت دیده‌اند
